基因组学与生物信息学
2006-2009 中国科学院北京基因组研究所,研究实习员
2009-2019 中国科学院北京基因组研究所,助理研究员
2019-2023 中国科学院微生物研究所,助理研究员
2023-至今 中国科学院微生物研究所,高级工程师
基于多组学与生物信息大数据,致力于发展人工智能驱动的病原体识别、变异评估与预测预警新方法,为疫苗设计、检测技术开发和精准防控提供计算基础,推动BT-IT融合的研究范式创新。
1. Lv Z*, Shu C*, Fu YL*, Li YH*, Fang SS*, Yao XJ, Sun QL, Peng KS, Lu J, Fan GM, Liu DM, Tang JZ, Zhong TS, Chen MM, Lin L, Du C, Luo GX, Luo MM, Shi XL, Wang X, Wu WH, Ma JC, Hu SN, Zou X, Hu QH, & Wu LH. Large-scale analysis of SARS-CoV-2 genomic data from sewage using eVarEPS reveals that amino acid mutations detected in sewage provide an early warning on population prevalence. Water Research. 2025; 287 (Part B): 124437. https://doi.org/10.1016/j.watres.2025.124437
2. Sun QL*, Shu C*, Liu YB, Lu J, Fan GM, Lv Z, Fu YL, Luo YF, Gao SH, Ma JC, Hu SN, & Wu LH. VarEPS-MPXV: A risk evaluation system for observed and virtual variations in mpox virus genomes. hLife (ISSN: 2949-9283). 2025. https://doi.org/10.1016/j.hlife.2025.04.003
3. Xiao B, Wu L, Sun Q, Shu C#, & Hu S#. Dynamic analysis of SARS-CoV-2 evolution based on different countries. Gene. 2024 Apr 3; 916: 148426. Epub ahead of print. https://doi.org/10.1016/j.gene.2024.148426.
4.Shu C*, Sun Q*, Fan G, Peng K, Yu Z, Luo Y, Gao S, Ma J, Deng T, Hu S, & Wu L. VarEPS-Influ: An risk evaluation system of occurred and virtual variations of influenza virus genomes. Nucleic Acids Res. 2023 Oct 27; Epub ahead of print. https://doi.org/10.1093/nar/gkad912.
5.Sun Q*, Shu C*, Shi W, Luo Y, Fan G, Nie J, Bi Y, Wang Q, Qi J, Lu J, Zhou Y, Shen Z, Meng Z, Zhang X, Yu Z, Gao S, Wu L, Ma J, & Hu S. Nucleic Acids Res. 2022 Jan 7; 50(D1): D888-D897. https://doi.org/10.1093/nar/gkab921.
1.“UGT1A新等位基因功能的研究及UGT1A基因多态性与伊立替康疗效和毒性的关系”;国家自然科学基金,青年科学基金项目。2015.01-2017.12; 主持
2.“精准医学大数据处理和利用的标准化技术体系建设”,国家重点研发计划“精准医学研究”重点专项 ;2016.07-2020.12 ;子课题负责人
3.“病原变异及其跨物种传播的回溯和演进方法体系构建”;国家重点研发计划“病原学与防疫技术体系研究”重点专项;2021.12-2024.11 ;子课题负责人
4.“病毒基因组未来变异演化预测与预警技术研发”;国家重点研发计划“生物与信息融合(BT 与 IT 融合)”重点专项;2022.11- 2025.10 ;子课题负责人