研发生涯伴随分子生物学、基因组学及合成生物学的科学进步和技术发展，参与中国首个微生物基因组计划，在国内最早一批建立酵母双杂交系统研究蛋白相互作用，首次对长链二元酸生产菌株进行了基因组学、转录组学及进化代谢组学系统研究，构建了适合野生型长链二元酸菌种的遗传操作系统，并通过代谢工程改造获得系列具有不同发酵优势的新菌株。研发技术涵盖大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、酵母类真核生物三大类细胞工厂，奠定了相关生物制造项目的技术源泉和基础。主持及参与多项院部级科研项目及横向合作项目，申请并获授权发明专利二十余项。

1. Xiaoqin Lai, Hongbing Shao, Fuying Hao, Li Huang. Biochemical characterization of an ATP-dependent DNA ligase from the hyperthermophilic crenarchaeon Sulfolobus shibatae. Extremophiles. 2002 Dec;6(6):469-77.
2. Bao Q, Tian Y, Li W, Xu Z, Xuan Z, Hu S, Dong W, Yang J, Chen Y, Xue Y, Xu Y, Lai X, Huang L, Dong X, Ma Y, Ling L, Tan H, Chen R, Wang J, Yu J, Yang H. A complete sequence of the T. tengcongensis genome. Genome Res. 2002 May;12(5):689-700.
3. Xiaoqin Lai, Li Huang. Biochemical properties of DNA ligase from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus shibatae. Progress in biochemistry and biophysics. 2005,32(2):122-128. In Chinese
4. Kangyun Wu, Xiaoqin Lai, Xin Guo, Jinchuan Hu, Xiaoyu Xiang, Li Huang. Interplay between Primase and Replication Factor C in the Hyperthermophilic Archaeon Sulfolobus solfataricus. Mol. Micro. 2007, 63(3):826-37.
5. Wen, R., Torres-Acosta, A., Pastushok, L., Lai, X., Pelzer, L., Wang, H. and Xiao, W.  Arabidopsis UEV1D promotes Lys63-linked polyubiquitination and is involved in DNA damage response. Plant Cell 2008, 20(1):213-27.
6. Gauri R. Nair*, Xiaoqin Lai*, Arlene A. Wise, Benjamin Wonjae Rhee, Mark Jacobs, and Andrew N. Binns. The integrity of the Agrobacterium tumefaciens Sensor kinase VirA periplasmic domain is critical for optimal coordination of the virulence signal response. J Bacteriol 2011 Mar;193(6):1436-48 (*equal contribution)

1、项目名称：长链二元酸生产新技术，项目来源：中国科学院“一三五”规划突破项目，项目编号：Y254031003，起止年月：2011.7-2015.12，子课题负责人。

2、项目名称：微生物发酵生产异戊二烯产业化技术研究，项目来源：院地合作，项目编号：2014110008000443 ，起止年月：2014-2016，共同负责人。

3、项目名称：月桂二酸的规模化稳定生成技术，项目来源：技术转让，项目编号：2017110008001459 ，签订日期：2017.4，共同负责人。

4、项目名称：生物法生产右旋龙脑的关键技术，项目来源：企业横向合作，起止年月：2015.10-2016.4，项目负责人。

5、项目名称：一种莱鲍迪苷D合成酶的构建及表达系统优化，项目来源：企业横向合作，起止年月：2016.7-2017.3，项目负责人。

6、项目名称：阿胶中微生物污染系统性研究及检测质控，项目来源：企业横向合作，起止年月：2021.11-2022.6，项目负责人。

7、项目名称：重组G-CSF蛋白工程菌株构建及表达纯化小试工艺优化，项目来源：企业横向合作，起止年月：2022.4-2024.12，共同负责人。