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农业室简介
农业微生物组学与生物技术研究室（以下简称“农业室”）是中科院微生物所的5个研究机构之一，于2022年6月10日更改为现名，其前身是农业微生物与生物技术研究室，由植物基因组学国家重点实验室（微生物所部分）组成。植物基因组学国家重点实验室成立于2003，由中国科学院微生物研究所与中国科学院遗传与发育生物学研究所共建，其前身是1990年成立的中国科学院植物生物技术开放实验室。在2006、2011、2016年的国家重点实验室评估中，植物基因组学国家重点实验室连续2次被评为优秀实验室，1次被评为良好实验室。实验室的总体定位为：从国家战略需求出发，以主要农作物、经济作物以及重要模式植物为材料，系统地开展植物和植物病原微生物的功能基因组学研究，着重于大规模新基因的克隆鉴定、功能分析和潜在应用价值的探索，推动植物生物技术的源头创新和转基因植物产业化。建立我国植物基因组学理论体系和技术平台，使实验室成为国内植物基因组学源头创新研究的中心，不断提高在国际上的竞争力和影响力。
农业室荣誉主任：方荣祥 研究员 中国科学院院士
农业室主任：叶健 研究员
农业室副主任：张杰 研究员
农业室主任助理：单淳敏 研究员；王芳芳 副研究员
农业室行政主管：王忠勤
农业室仪器平台技术主管：武瑶、苏鸓、王海云
研究领域
农业室主要以我国农作物的重要微生物病害，如植物病毒病、棉花黄萎病和十字花科植物细菌病等作为研究模式，开展病原微生物与植物相互作用分子机理、植物抗病生物技术的基础研究和应用基础研究，近期的研究重点为病原体－介体昆虫－植物三者间的相互作用。
研究队伍
农业室现有创新研究组和团队14个，青年研究组1个；现有固定人员共计40人，其中正高级职称16人（含研究员12人，项目研究员3人，包括有院士1人，国家杰出青年基金获得者4人，海外和国家优秀青年基金获得者3人，引进人才5人，科发奖省部级一等奖获得者1人和中国科学院青年创新促进会会员6人），副高级职称16人，中级职称8人。目前有特别研究助理18人，国科大研究生82人，联合培养研究生52人，项目聘用、返聘、劳务、客座人员约40余人。
研究平台
依托国家重点实验室专项经费和中央修购项目等资助，研究室装备有种类齐全的从事植物－微生物相互作用研究的设备和装置。公共核设备总值约3000万元，全部对内、对外开放使用。
研究组
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研究组名称：基因表达调控与植物生物技术研究组长：方荣祥 研究员 中国科学院院士 研究室荣誉主任
研究方向：1. 植物病毒-媒介昆虫-植物寄主三者互作的分子机制；2. 以植物为生物反应器生产有用蛋白； |
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研究组名称：虫媒微生物与宿主互作研究组长：叶健 研究员 农业室主任 2021年获国家杰出青年科学基金项目资助，2015年获国家优秀青年科学基金项目资助
研究方向：1.病原微生物—媒介昆虫—宿主三者互作机制解析；2. 植物抵御病原感染免疫网络解析；3. 虫媒柑橘黄龙病的宿主抗病机制及抗病生物技术 |
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研究组名称：植物免疫调控机理研究组长：张杰 研究员 农业室副主任 2019年获国家优秀青年科学基金项目资助
研究方向：1.植物免疫激活的分子机制；2.病原微生物的致病机理
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研究组名称：植物病原细菌致病分子机制研究组长：钱韦 研究员 所长 植物基因组学国家重点实验室副主任 2018年获国家杰出青年科学基金项目资助
研究方向：1.细菌识别寄主与环境刺激的分子机制; 2. 细菌双组分信号转导系统的信号传递与整合机制；3.适应性进化的分子生物学基础 |
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研究组名称：RNA沉默和植物抗病机制研究组长：郭惠珊 研究员 2005年获国家杰出青年科学基金项目资助
研究方向：1.植物RNA沉默的分子机制及其抗病应用研究；2.植物与真菌的互作机理及维管束真菌病害的防控策略研究 |
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研究组名称：植物免疫分子机制及生物技术研究组长：邱金龙 研究员
研究方向：1.植物免疫分子机制；2.生物技术通用方法的研究 |
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研究组名称：植物发育与免疫应答的细胞信号网络研究组长：孔照胜 研究员
研究方向：1.细胞骨架-质膜-细胞壁连续体时空调控植物细胞形态建成；2.植物-微生物互作的细胞信号网络 |
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研究组名称：病原菌植物跨界信号传递研究组长：贾燕涛 研究员
研究方向：1.病原微生物与植物相互识别分子机理； 2. 病原菌与植物跨界信号传递调控网络研究 |
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研究组名称：真菌及与植物互作的表观遗传调控机理研究组长：单淳敏 研究员 农业室主任助理 2021年获海外优秀青年科学基金项目资助
研究方向：1.真菌异染色质组装、表观遗传修饰及其跨代遗传的分子调控机制； 2. 植物-真菌互作的表观遗传学调控机制 |
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研究组名称：虫媒病与微生物组研究组长：张莉莉 项目研究员
研究方向：1.植物-媒介昆虫-植物病毒三者互作的分子机制；2.共生基因组育种
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研究组名称：植物营养与微生物群的关系青年研究组长：颜永胜 项目研究员
研究方向：1.植物营养高效利用的机制；2.植物营养与微生物群相互调控的机制
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研究组名称：卵菌基因组学和宿主免疫机制研究组长：林啸 研究员 2023年获海外优秀青年科学基金项目资助
研究方向：1.卵菌基因组、效应子组；2.新植物免疫受体的克隆和应用；3.植物-病原互作的分子机制 |
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研究组名称：病原与宿主蛋白翻译调控研究组长：王金龙 研究员 2023年获海外优秀青年科学基金项目资助
研究方向：1.病原与植物互作中的信号传递以及蛋白翻译调控机制，为病原菌防治和农作物抗病应用提供参考与新靶点；2.蛋白翻译在生物大分子生产中的应用 |
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研究组名称：光遗传学与抗病免疫研究组长：丁美琪 研究员
研究方向：1. 新型光遗传学生物技术的开发；2. 利用光遗传学技术调控植物生长发育；3. 解析植物免疫分子机制 | | 
