• 国家优秀青年基金项目，课题号31922002，链霉菌次级代谢调控机制和高产策略，2020/01-2022/12，直接经费：130万，在研，主持（王为善）
• 国家自然科学基金面上项目，课题号31770055，基于原核生物别构转录因子的全新小分子检测方法研究，2018/01-2021/12，直接经费：64万元，在研，主持 （王为善）
• 国家自然科学基金面上项目，课题号31570031，链霉菌中ScbR2类抗生素受体介导的信号转导机制研究，2016/01-2019/12, 76万元，在研，主持 （王为善）
• 国家自然科学基金青年基金，课题号31400034，开发适用于链霉菌的新型诱导表达系统，2014/01-2017/12，26万元，结题，主持 （王为善）
• 中科院青年创新促进会人才项目，课题号2016087，链霉菌聚酮类药物高产菌工程改造策略研究，2016/01-2019/12, 70万元，在研，主持 （王为善）
• 中国科学院微生物资源前期开发国家重点实验室前沿探索课题，课题号 08KF0110XX，细菌別构转录因子资源的新应用——全新体外小分子检测策略研究，2018.07-2020.07，5万元，在研，主持 （王为善）
• 中国科学院微生物研究所人才培养基金，课题号Y5FJ011023，开发适用于链霉菌的新型诱导表达系统及其应用研究， 2015.09-2017.08，10万，结题，主持 （王为善）

• 　　北京市自然科学基金青年项目，课题号5154032，利用时序启动子理性改造链霉菌聚酮生物合成的前体供应途径，8万，2015.01-2016.12，结题，主持 （王为善） 

• 　　重点研发计划子课题，课题号2020YFA0909804，核黄素高温生产底盘细胞的构建与系统优化，72.84万，2020.07-2025.06，在研，主持（李子龙） 

横向项目：  

• 中国科学院微生物研究所与河北圣雪大成制药有限责任公司合作开发项目：合同编号2014110008001348，土霉素和金霉素高产工程菌构建；2014.05.01 - 2017.04.30，结题，参与（王为善，李子龙） 
• 中国科学院微生物研究所与河北圣雪大成制药有限责任公司合作开发项目：合同编号2017110008001938，关于去甲四环素、土霉素工程菌株构建的开发合同；2017.06.01 - 2020.05.30，在研，主持（李子龙）
• 中国科学院微生物研究所与河北圣雪大成制药有限责任公司合作开发项目：合同编号2017110008001939，关核黄素工程菌株构建的开发合同；2017.06.01 - 2020.05.30，在研，主持（李子龙）
• 中国科学院微生物研究所与江苏一鸣生物股份有限公司合作开发项目：合同编号2019110008001278，TG酶（谷氨酰胺转氨酶）的关键技术开发；2019.05.06 - 2022.05.05，在研，主持（李子龙）