国家自然科学基金项目“大陆科学钻探深孔区地下深部流体与微生物研究”，“木霉纤维素酶表达调控研究”、国家973计划项目“科学深钻的地下微生物及地下流体研究”、国家十五“863“计划项目“未培养微生物基因资源的利用”、“生产燃料酒精用工程菌及高效纤维素酶的研究”、“纸浆生物漂白和造纸黑液超微处理的应用”和中国科学院知识创新项目“生物质高效转化微生物菌种选育与优化”，国家十一五“863”重点课题“食品用酶及抗氧化酶产品研制与开发”。国家十二五“973”项目“木质纤维素生物降解多样性、新降解因子及相关机理”，国家自然科学基金项目“木霉纤维素酶表达调控研究”、中国科学院知识创新重大课题“纤维素乙醇的高温发酵和生物炼制”。