近年来生物学研究的手段日新月异，新的技术方法及其相应的仪器层出不穷，就显微成像与分析技术而言，能够高分辨率、多角度、快速动态地在细胞、亚细胞和分子水平上对生命体的生命活动过程展开全方位、多尺度的研究势在必行。鉴于此所级中心于2009年成立之初，就把显微观察与分析技术平台做为主要平台来建设，并通过每年的仪器和人员的更新逐步完善了平台技术体系。
显微观察与分析技术平台利用各类仪器支撑科研，场发射扫描电镜配备冷冻制备传输系统，在忠实于样品原貌的基础上，以超高分辨率观察样品表面超微结构；利用透射电镜观察生物等低衬度样品的超微结构；利用激光共聚焦显微镜在高分辨率、高灵敏度基础上实现对弱荧光的捕捉和捕获瞬间的荧光变化；通过流式细胞仪可进行细胞或微生物颗粒的分析或分选，并且提供了偏振光、小颗粒等特殊检测模块，实现了高速高纯度的细胞分选。
仪器设备：目前平台拥有各类显微观察与分析类设备共12台套，总价值2100多万元，具体包括场发射扫描电子显微镜Hitachi-SU010、透射电子显微镜JOEL JEM-1400、激光共聚焦扫描显微镜Leica TCS SP8 （2台）、转盘式激光共聚焦显微镜ΜLtraView VoX、流式细胞仪BD Influxd及配套设备
技术队伍：
平台现有专职技术人员6名，其中博士3人，具有高级技术职称人员4名，平台负责人李春立博士，荣获2017年度中国科学院北京生命科学大型仪器区域中心优秀个人。技术队伍具体情况如下表。
显微观察与分析技术平台技术队伍
技术平台