微生物的生物多样性，使其代谢产物具有结构和功能多样性，微生物活性/功能代谢产物是现代各种创新药物发现的重要来源。代谢产物及化学生物学平台将微生物学、化学与生物学的研究方法和技术紧密结合，开展大规模、自动化、高通量的微生物代谢产物（包括代谢中间产物）及代谢产物组分库制备、活性物质筛选、化合物分子表征、代谢产物的分离筛选、活性化合物结构分析等工作。该平台为微生物发酵、层析分离、色质谱分析鉴定、功能筛选、结构解析等多学科交叉的技术集成，主要应用于微生物资源、病原微生物、工业微生物、环境微生物及农业微生物等领域的研究与开发工作。该平台于2010年通过修购项目购置高分辨液质联用仪开始建设，经过8多年的发展，已经由最初的液相-质谱分析逐步向功能物质制备与鉴定转变。平台依托微生物研究所独特的微生物资源库，对其代谢产物进行系统的化学生物学研究，以期实现活性物质快速分离、结构表征和应用研究，以为解决人类健康生活和农业生产中的一系列问题，为社会可持续发展提供保障。
仪器设备：平台拥有可用于微生物功能物质制备与鉴定的核磁共振谱仪、质谱仪、光谱仪及高效液相色谱等仪器，具体包括布鲁克500兆超导核磁共振波谱仪1台（Bruker Avance 500 MHz）、液质联用高分辨质谱仪1台(Agilent 1200HPLC/ 6520QTOFMS)、圆二色光谱仪1台(Chirascan)、气相色谱质谱联用仪2台(Shimadzu 2010 ultra GC/MS)、高效液相色谱8台、紫外、红外与旋光光谱仪、活性测试所用的多功能酶标仪，以及2017年修购专项购置的小分子全自动制备型HPLC和活性多糖分离鉴定色谱系统等，总价值1160万元
技术队伍：目前，本平台由4名专业技术人员组成，均为博士、其中3人为高级职称，近5年来，平台人员承担了2项院仪器设备功能开发项目。平台人员具体情况如下表。
代谢产物与化学生物学平台技术队伍
技术平台