组长：崔颖璐 博士、项目研究员
研究组研究方向
1.人工智能酶设计与应用
2.碳资源高效利用与循环经济
研究组研究内容及意义
微生物酶是微生物进行物质转化的核心元件。深入研究微生物酶的进化机制及反应机理，拓展其在非天然底物中对碳、氮等元素的代谢利用，可为发展低碳生物制造提供重要支持。传统的酶学研究方法受到一定的通量限制，难以满足微生物应用领域发展的迫切需求。计算生物技术的发展为微生物酶资源宝库的深度挖掘及精准设计提供了创新的研究思路。我们将前沿计算技术应用于微生物酶学研究中，发展了“酶功能重塑”、“酶骨架设计”等基于人工智能模型及力场函数的计算设计方法，并面向微生物碳、氮元素代谢途径中的重要酶，在干湿结合的研究体系基础上，深入理解微生物酶进化过程中暗藏的复杂规律，拓展其非天然催化功能，推动了微生物利用非天然碳源的绿色循环经济发展。
研究队伍
研究组长
崔颖璐
主要学习及工作经历
2006-2010年 吉林大学，化学学院，学士
2010-2015年 吉林大学，理论化学研究所，博士
2015-2017年 北京林业大学，计算生物学中心，博士后
2017-2021年 中国科学院微生物研究所，助理研究员
2021-2024年 中国科学院微生物研究所，副研究员
2024-至今 中国科学院微生物研究所，项目研究员
获奖情况
2022年入选中国科学院青年创新促进会会员
2023年获中国微生物学会酶工程专业委员会“青年酶工程学家奖”
2024年获得国家自然科学基金优秀青年项目资助
学术任职
中国毒理学会计算毒理学专业委员会委员
中国化工学会生物化工专委会-青年学者工作委员会委员
Green Carbon期刊青年编委
在读研究生
刘于梓陌 硕士生 （2023-）
代表性论文
1. Yinglu Cui#*, Yanchun Chen#, Jinyuan Sun#, Tong Zhu#, Hua Pang, Chunli Li, Wen-Chao Geng, Bian Wu*. Computational redesign of a hydrolase for nearly complete PET depolymerization at industrially relevant high-solids loading, Nature Communications, 2024, 15: 1417.
2. Yue Tang#, Xiaoying Tian#, Min Wang#, Yinglu Cui#, Yang She#, Zhaoxiang Shi, Jiaqi Liu,Huijin Mao, Lilu Liu, Chao Li, Yuwei Zhang, Pengwei Li, Yue Ma, Jinyuan Sun, Qing Du, Jie Li, Jun Wang, De-feng Li, Bian Wu*, Feng Shao*, Yihua Chen*. The β-d-manno-heptoses are immune agonists across kingdoms. Science, 2024, 385: 678-684.
3. Yinglu Cui, Jinyuan Sun, Bian Wu*. Computational enzyme redesign: large jumps in function, Trends in Chemistry, 2022, 4(5): 409-419.
4. Yinglu Cui#, Yinghui Wang#, Wenya Tian#, Yifan Bu, Tao Li, Xuexian Cui, Tong Zhu, Ruifeng Li, Bian Wu*. Development of a versatile and efficient C-N lyase platform for asymmetric hydroamination via computational enzyme redesign, Nature Catalysis, 2021, 4: 364-373.
5. Yinglu Cui#, Yanchun Chen#, Xinyue Liu, Saijun Dong, Yu’e Tian, Yuxin Qiao, Ruchira Mitra, Jing Han, Chunli Li, Xu Han, Weidong Liu, Quan Chen, Wangqing Wei, Xin Wang, Wenbin Du, Shuangyan Tang, Hua Xiang, Haiyan Liu, Yong Liang, Kendall N. Houk, Bian Wu. Computational redesign of a PETase for plastic biodegradation under ambient condition by the GRAPE strategy, ACS Catalysis, 2021, 11(3): 1340-1350.
研究中代表性图片
