分类系统承载了生物多样性信息，在生物多样性研究、保护和可持续利用中发挥重要的基础作用。担子菌门（Basidiomycota）是真菌界中仅次于子囊菌门的第二大类群，物种超过4万种，约占已知真菌总物种数的1/3；包含了绝大多数食药用菌、毒蘑菇等大型真菌及锈菌、黑粉菌等重要的植物病原真菌，具有重要的生态价值，与人类经济活动关系紧密。但担子菌门各级分类系统存在相互矛盾、部分名称不合法、分类系统和系统发育关系不吻合等问题。
赵瑞琳团队以488个物种的基因组数据为基础，通过提取1764个直系单拷贝同源基因构建担子菌门系统演化基因组发育图谱（图1）并估算各个阶元演化时间范围，更新了担子菌门分类系统至4亚门、20纲、77目、297科和2134属。团队同时编撰了担子菌门目等级的分类词典，澄清多个分类学问题，进一步稳定了担子菌门分类系统。相关研究成果在中科院微生物所国家微生物科学数据中心相关网站同步更新https://nmdc.cn/macrofungi/，提供了完整准确的分类信息。
该项研究由25个国家93名真菌学者共同完成，中国科学院微生物研究所贺茂强博士后、曹槟助理研究员和刘飞助理研究员为文章共同第一作者，赵瑞琳研究员为通讯作者，论文以“Phylogenomics, divergence times ａｎｄ notes of orders ｉｎ Basidiomycota”为题在线发表在Fungal Diversity上 。
该研究获得国家重点研发计划项目（2022YFD1200605）、国家自然科学基金 （32100011，31961143010，31970010）等多个项目支持。
图1 担子菌门系统发育基因组图谱
原文链接：https://doi.org/10.1007/s13225-024-00535-w
