我院出台“特别研究助理”政策以来，微生物所结合研究生培养周期、成长通道和各类人才支持政策，精准发力，有效衔接，于2020年研究出台了进一步加强特别研究助理队伍建设的通知，建立了“研究生-博士后-青年人才”自主培养体系，设立了研究所博士后“微苗奖励计划”，持续推进管理机制改革，促进博士后队伍数量和质量大幅跃升。
截至2024年11月底，研究所博士后在站总人数达172人，比2019年在站博士后总数增加198.5%，达到了历年来的人数新高。入站的博士后人员构成更为年轻化，涉及合作导师团队更广泛，科研成果更为突出。博士后在站期间获得国家高层次人才（青年）计划2人，科协“人才托举工程”3人，博士后在站期间直接参加研究所副研究员岗位竞聘中获得聘任多人。
积极组织和鼓励博士后（特别研究助理）申报国家高层次人才计划、国自然科学基金、中国博士后基金会各类项目资助以及中国科学院特别研究助理项目资助，近年来获资助人数保持良好的增长态势。博士后队伍已经成为研究所科技创新的重要力量之一，青年人才“蓄水池和培养田”作用日渐凸显。
2024年，共有28位博士后分别获得不同类型科研项目资助及奖项。其中，获得国家高层次人才（青年）计划1人；获得国自然面上项目1人；获得国自然青年基金10人；获得国家资助博士后研究人员计划（B、C类）5人；获得博士后基金第17批特别资助项目4人；获得博士后面上基金资助7人。
2024年获项目资助名单如下：
国家高层次人才（青年）计划： 刘科芳（合作导师：高 福）
国自然面上项目： 王 聪（合作导师：高 程）
国自然青年科学基金： 陈 磊（合作导师：王琳淇）、段泽宇（合作导师：刘 晓）、李艳华（合作导师：高 福）、刘 青（合作导师：林 啸）、邵 菲（合作导师：王 硕）、舒 宪（合作导师：李 明）、王海婷（合作导师：单淳敏）、王 涛（合作导师：刘宏伟）、张宏娇（合作导师：尹文兵）、张雨薇（合作导师：陈义华）
国家资助博士后研究人员计划（B、C类）： B类：陈艳春（合作导师：吴 边）、舒 宪（合作导师：李 明） C类：韩雨旋（合作导师：戴连攀）、鲁晶晶（合作导师：王 军）、张若婵（合作导师：刘龙超）
博士后基金第17批特别资助： 陈 磊（合作导师：王琳淇）、柯维鑫（合作导师：王琳淇）、王 聪（合作导师：高 程）、赵振楠（合作导师：高 福）
博士后第75、76批面上基金： 陈 萌（合作导师：陈义华）、刘 青（合作导师：林 啸）、梁芷健（合作导师：叶 健）、任旭皎（合作导师：高 福）、舒 宪（合作导师：李 明）、张宏娇（合作导师：尹文兵）、张 磊（合作导师：邓 涛）
近年来，研究所高度重视博士后人才队伍建设，不断创新思路，深挖潜力，为研究所改革创新发展提供了强有力的人才保障和智力支撑。研究所将进一步为博士后建立更为完善的发展平台，激励博士后人员潜心研究，提升科研能力，为研究所高水平科研队伍建设提供后备力量。
